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Journal articles
Complete Genome Sequences of Four Microbacterium Strains Isolated from Metal- and Radionuclide-Rich Soils
Philippe Ortet
1, 2, *
Nicolas Gallois
1, 3
Justine Long
1, 2
Séverine Zirah
4
Catherine Berthomieu
1, 3
J. Armengaud
5
Béatrice Alpha-Bazin
6
Mohamed Barakat
1, 2
Virginie Chapon
1, 3
*
Corresponding author
2
LEMIRE - Laboratoire d'Ecologie Microbienne de la Rhizosphère et d'Environnements Extrêmes
BIAM - Institut de Biosciences et Biotechnologies d'Aix-Marseille (ex-IBEB) : DRF/BIAM
3
IPM - Interactions Protéine Métal
BIAM - Institut de Biosciences et Biotechnologies d'Aix-Marseille (ex-IBEB) : DRF/BIAM
6
LI2D - Laboratoire Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic
SPI - Service de Pharmacologie et Immunoanalyse : DRF/JOLIOT
Philippe Ortet 1, 2
Correspondent author
Nicolas Gallois 1, 3
Author
Justine Long 1, 2
Author
Séverine Zirah 4
Author IdHAL : severine-zirah ORCID : https://orcid.org/0000-0001-6082-8414
Catherine Berthomieu 1, 3
Author IdHAL : cb134142 ORCID : https://orcid.org/0000-0001-8784-5396
J. Armengaud 5
Author IdHAL : jean-armengaud ORCID : https://orcid.org/0000-0003-1589-445X
Béatrice Alpha-Bazin 6
Author
Mohamed Barakat 1, 2
Author
Virginie Chapon 1, 3
Author IdHAL : virginie-chapon ORCID : https://orcid.org/0000-0002-2365-3464
1
BIAM - Institut de Biosciences et Biotechnologies d'Aix-Marseille (ex-IBEB) (Anciennement "Institut de Biologie Environnementale et Biotechnologie (IBEB)"
Centre CEA Cadarache
13108 Saint Paul lez Durance
- France)
- DRF (CEA) - Direction de Recherche Fondamentale (CEA) : DRF/BIAM (Direction de Recherche Fondamentale
Fundamental Research Division
CEA Saclay
91191 Gif-sur-Yvette
- France)
- CEA - Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (Centre de Saclay Centre de Grenoble Centre de Cadarache etc - France)
- AMU - Aix Marseille Université : UMR 7265 (Aix-Marseille Université Jardins du Pharo 58 Boulevard Charles Livon 13284 Marseille cedex 7 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR 7265 (France)
2
LEMIRE - Laboratoire d'Ecologie Microbienne de la Rhizosphère et d'Environnements Extrêmes (France)
- BIAM - Institut de Biosciences et Biotechnologies d'Aix-Marseille (ex-IBEB) : DRF/BIAM (Anciennement "Institut de Biologie Environnementale et Biotechnologie (IBEB)"
Centre CEA Cadarache
13108 Saint Paul lez Durance
- France)
- DRF (CEA) - Direction de Recherche Fondamentale (CEA) : DRF/BIAM (Direction de Recherche Fondamentale
Fundamental Research Division
CEA Saclay
91191 Gif-sur-Yvette
- France)
- CEA - Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (Centre de Saclay Centre de Grenoble Centre de Cadarache etc - France)
- AMU - Aix Marseille Université : UMR 7265 (Aix-Marseille Université Jardins du Pharo 58 Boulevard Charles Livon 13284 Marseille cedex 7 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR 7265 (France)
- DRF (CEA) - Direction de Recherche Fondamentale (CEA) : DRF/BIAM (Direction de Recherche Fondamentale
Fundamental Research Division
CEA Saclay
91191 Gif-sur-Yvette
- France)
3
IPM - Interactions Protéine Métal (France)
- BIAM - Institut de Biosciences et Biotechnologies d'Aix-Marseille (ex-IBEB) : DRF/BIAM (Anciennement "Institut de Biologie Environnementale et Biotechnologie (IBEB)"
Centre CEA Cadarache
13108 Saint Paul lez Durance
- France)
- DRF (CEA) - Direction de Recherche Fondamentale (CEA) : DRF/BIAM (Direction de Recherche Fondamentale
Fundamental Research Division
CEA Saclay
91191 Gif-sur-Yvette
- France)
- CEA - Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (Centre de Saclay Centre de Grenoble Centre de Cadarache etc - France)
- AMU - Aix Marseille Université : UMR 7265 (Aix-Marseille Université Jardins du Pharo 58 Boulevard Charles Livon 13284 Marseille cedex 7 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR 7265 (France)
- DRF (CEA) - Direction de Recherche Fondamentale (CEA) : DRF/BIAM (Direction de Recherche Fondamentale
Fundamental Research Division
CEA Saclay
91191 Gif-sur-Yvette
- France)
4
MCAM - Molécules de Communication et Adaptation des Micro-organismes (57 rue Cuvier - 75005 Paris - France)
- MNHN - Muséum national d'Histoire naturelle (57, rue Cuvier - 75231 Paris Cedex 05 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR7245 (France)
5
LBSP - Laboratoire de Biochimie des Systèmes Perturbés (France)
- CEA - Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives : DSV/IBEB (Centre de Saclay Centre de Grenoble Centre de Cadarache etc - France)
6
LI2D - Laboratoire Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic (Lab. Innovative Technologies for detection and diagnostics
BP 17171
Bagnols-sur-Cèze - France)
- SPI - Service de Pharmacologie et Immunoanalyse : DRF/JOLIOT (France)
- MTS - Médicaments et Technologies pour la Santé : DRF/JOLIOT (CEA
- SPI
- Bât. 136 Saclay 91191 GIF-SUR-YVETTE - France)
- Université Paris-Saclay (Espace Technologique, Bat. Discovery - RD 128 - 2e ét., 91190 Saint-Aubin - France)
- DRF (CEA) - Direction de Recherche Fondamentale (CEA) : DRF/JOLIOT (Direction de Recherche Fondamentale
Fundamental Research Division
CEA Saclay
91191 Gif-sur-Yvette
- France)
- CEA - Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (Centre de Saclay Centre de Grenoble Centre de Cadarache etc - France)
- INRAE - Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement : UMR0496 (France)
- MTS - Médicaments et Technologies pour la Santé : DRF/JOLIOT (CEA
- SPI
- Bât. 136 Saclay 91191 GIF-SUR-YVETTE - France)
Abstract : Here, we present the genome sequences of four Microbacterium strains, which were isolated at different locations in Europe from metal-or radionuclide-rich soils. High-quality complete genome sequences were obtained with PacBio and Illu-mina data sets with an original two-step procedure.
Document type :
Journal articles
Complete list of metadata
https://hal-cea.archives-ouvertes.fr/cea-02363446
Contributor : Alexandra Maraval <>
Submitted on : Thursday, November 14, 2019 - 2:10:58 PM
Last modification on : Saturday, July 3, 2021 - 12:12:21 AM
Long-term archiving on: : Saturday, February 15, 2020 - 2:44:04 PM
Contributor : Alexandra Maraval <>
Submitted on : Thursday, November 14, 2019 - 2:10:58 PM
Last modification on : Saturday, July 3, 2021 - 12:12:21 AM
Long-term archiving on: : Saturday, February 15, 2020 - 2:44:04 PM
File
Microbiology Resource Announce...
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Identifiers
- HAL Id : cea-02363446, version 1
- DOI : 10.1128/mra.00846-19
- WOS : 000490937700002
- PUBMED : 31624160
Collections
Citation
Philippe Ortet, Nicolas Gallois, Justine Long, Séverine Zirah, Catherine Berthomieu, et al.. Complete Genome Sequences of Four Microbacterium Strains Isolated from Metal- and Radionuclide-Rich Soils. Microbiology Resource Announcements, American Society for Microbiology, 2019, 8 (42), ⟨10.1128/mra.00846-19⟩. ⟨cea-02363446⟩
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