MeQA: a pipeline for MeDIP-seq data quality assessment and analysis

J. Huang , Valérie Renault (1) , J. Sengenes , N. Touleimat (2) , S. Michel (3) , M. Lathrop (4) , J. Tost

1 LIUM - Laboratoire d'Informatique de l'Université du Mans
2 CEA - Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives
3 IBCP - Institut de biologie et chimie des protéines [Lyon]
4 CNG - Centre National de Génotypage

Domaines: Mathématiques [math]; Sciences du Vivant [q-bio]; Biochimie, Biologie Moléculaire; Génomique, Transcriptomique et Protéomique [q-bio.GN]; Biologie cellulaire; Bio-Informatique, Biologie Systémique [q-bio.QM]; Cancer; Génétique; Médecine humaine et pathologie

J. Huang, Valérie Renault, J. Sengenes, N. Touleimat, S. Michel, et al.. MeQA: a pipeline for MeDIP-seq data quality assessment and analysis. Bioinformatics, 2012, 28 (4), pp.587 - 588. ⟨10.1093/bioinformatics/btr699⟩. ⟨cea-01833166⟩