Enterotypes of the human gut microbiome - CEA - Commissariat à l’énergie atomique et aux énergies alternatives Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Nature Année : 2013

Enterotypes of the human gut microbiome

Manimozhiyan Arumugam
Jeroen Raes
  • Fonction : Auteur
Eric Pelletier
Denis Le Paslier
Takuji Yamada
  • Fonction : Auteur
Daniel Mende
  • Fonction : Auteur
Gabriel Fernandes
  • Fonction : Auteur
Julien Tap
Thomas Bruls
Marcelo Bertalan
  • Fonction : Auteur
Natalia Borruel
  • Fonction : Auteur
Francesc Casellas
  • Fonction : Auteur
Leyden Fernandez
  • Fonction : Auteur
Laurent Gautier
  • Fonction : Auteur
Torben Hansen
Masahira Hattori
  • Fonction : Auteur
Tetsuya Hayashi
  • Fonction : Auteur
Michiel Kleerebezem
  • Fonction : Auteur
Ken Kurokawa
  • Fonction : Auteur
Chaysavanh Manichanh
  • Fonction : Auteur
H Nielsen
Trine Nielsen
Julie Poulain
Junjie Qin
  • Fonction : Auteur
Thomas Sicheritz-Ponten
  • Fonction : Auteur
Sebastian Tims
  • Fonction : Auteur
David Torrents
  • Fonction : Auteur
Edgardo Ugarte
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Erwin Zoetendal
  • Fonction : Auteur
Jun Wang
Francisco Guarner
  • Fonction : Auteur
Oluf Pedersen
Willem de Vos
  • Fonction : Auteur
Søren Brunak
  • Fonction : Auteur
Jean Weissenbach
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 911249
Peer Bork
  • Fonction : Auteur

Résumé

Our knowledge on species and function composition of the human gut microbiome is rapidly increasing, but it is still based on very few cohorts and little is known about their variation across the world. Combining 22 newly sequenced fecal metagenomes of individuals from 4 countries with previously published datasets, we identified three robust clusters (enterotypes hereafter) that are not nation or continent-specific. We confirmed the enterotypes also in two published, larger cohorts suggesting that intestinal microbiota variation is generally stratified, not continuous. This further indicates the existence of a limited number of well-balanced host-microbial symbiotic states that might respond differently to diet and drug intake. The enterotypes are mostly driven by species composition, but abundant molecular functions are not necessarily provided by abundant species, highlighting the importance of a functional analysis for a community understanding. While individual host properties such as body mass index, age, or gender cannot explain the observed enterotypes, data-driven marker genes or functional modules can be identified for each
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MetaHIT Consortium (additional members) et al. - 2011 - Enterotypes of the human gut microbiome.pdf (1.5 Mo) Télécharger le fichier
Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)

Dates et versions

hal-03649169 , version 1 (22-04-2022)

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Citer

Manimozhiyan Arumugam, Jeroen Raes, Eric Pelletier, Denis Le Paslier, Takuji Yamada, et al.. Enterotypes of the human gut microbiome. Nature, 2013, 473 (7346), pp.174 - 180. ⟨10.1038/nature09944⟩. ⟨hal-03649169⟩
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